在酸盐饥饿期间,控制转录组变化和裂变酵母的时间寿命的因素

科学领域:

• * 分子和细胞生物学
• * 酵母遗传学公司
• * 营养物质的新陈代谢

背景情况:

• * 无机酸盐 (Pi) 饥饿导致 * Schizosaccharomyces pombe * (裂变酵母) 中显著的转录组变化.
• * 关键的适应性反应包括对核糖体生物发生和翻译的下调,以及对自和酸盐调动通路的上调.
• * 研究了自,转录因子 Pho7 和 Pi 饥饿反应中的 *ecl* 基因家族的作用.

研究的目的:

• * 阐明自,Pho7和ecl基因在酸盐饥饿期间对裂变酵母生存的特定贡献.
• * 描述在酸盐剥夺期间由Pho7控制的调节网络.
• * 了解ecl*基因删除对基因表达和在营养压力下细胞寿命的影响.

主要方法:

• *对裂变酵母菌株进行基因操纵 (例如, *atg1Δ*, *pho7Δ*, *ecl3Δ*, *ecl123Δ*).
• *使用RNA测序来分析基因表达变化的转录组概况.
• *在酸盐限制条件下对细胞存活的表型分析.

主要成果:

• *ATG1* (自因子) 或PHO7* (转录因子) 的删除导致了缺乏酸盐的细胞过早死亡.
• * Pho7 是参与酸盐获取,调动和其他饥饿诱导基因的关键激活剂,包括 * ecl3 *.
• *虽然*ecl3Δ*没有影响,但删除所有*ecl*基因 (*ecl123Δ*) 缩短了慢性酸盐饥饿期间的寿命,与氨基酸-tRNA合成酶的更广泛下调有关.
• * *pho7Δ*细胞与野生类型细胞相比,对核糖体蛋白基因的下调调节较少.

结论:

• *自和Pho7在酸盐饥饿期间对裂变酵母的生存至关重要.
• * Pho7调节了一组比PHO规律中定义的更广泛的基因,影响酸盐平衡和饥饿反应.
• * *ecl*基因家族,特别是在组合中,在长时间的营养压力期间,在维持细胞功能和寿命方面发挥着作用.
• *了解这些途径对于理解裂变酵母酸盐稳态和适应策略至关重要.