在先进的艾滋病毒感染中,SARS-CoV-2变种的快速出现和演变
Sung Hee Ko1, Pierce Radecki1, Frida Belinky1
1Vaccine Research Center, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA.
先进的艾滋病毒感染驱动了个体内的SARS-CoV-2显著演变,导致遗传多样性增加和新变异的潜力. 这突显了免疫状况对病毒适应和持续感染的影响.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 进化生物学 进化生物学
背景情况:
- 免疫功能低下个体的持续性SARS-CoV-2感染与变体进化有关,但潜在的机制尚不清楚.
- 了解宿主内病毒演变对于管理持续性感染和防止新变异的出现至关重要.
研究的目的:
- 为了研究SARS-CoV-2的宿主内进化,特别是尖基因,在患有晚期HIV感染的人群中.
- 确定宿主内部遗传多样性的增加是否与长时间的病毒分泌和抗体逃生突变的出现有关.
主要方法:
- 采用高通量,单基因组放大和测序 (HT-SGS) 来分析来自呼吸道样本的SARS-CoV-2尖端基因序列.
- 艾滋病毒感染者 (PWH) 患有晚期疾病 (CD4计数<200细胞/μL) 的病毒遗传多样性与CD4计数较高的人和没有艾滋病毒的人 (PWOH) 的病毒遗传多样性进行比较.
主要成果:
- 与具有较高CD4计数的PWOH和PWH相比,晚期HIV患者表现出明显更高的宿主内尖峰基因多样性.
- 症状出现后的主体内多样性尖峰的增加预测了PWH中较长时间的SARS-CoV-2RNA分泌.
- 在先进的HIV中观察到尖端序列群体的快速波动,高突变负担和关键残留物的积极选择.
- 抗体逃生突变的出现与抗体检测延迟有关.
结论:
- 先进的HIV感染促进了显著的宿主内部遗传多样性和SARS-CoV-2的适应性进化.
- 这种宿主内部的进化可能有助于出现令人担忧的新型SARS-CoV-2变种.
- 针对免疫受损人群的有针对性的干预措施对于缓解病毒演变和传播至关重要.
更多相关视频
13:58Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays
Published on: September 26, 2011
08:41Live Imaging and Quantification of Viral Infection in K18 hACE2 Transgenic Mice Using Reporter-Expressing Recombinant SARS-CoV-2
Published on: November 5, 2021
相关概念视频
Viral Mutations
Retrovirus Life Cycles
Rous Sarcoma Virus (RSV) and Cancer
RSV is a retrovirus that contains two copies of a plus-strand RNA genome. Its genome consists of four main open...
Viral Recombination
Mechanisms of Retrovirus-induced Cancers
Retroviruses
