SARS-CoV-2 Mpro Dimer-Based Screening System:一种合成生物学工具,用于识别具有阻二元化潜力的化合物
Ernawati Arifin Giri-Rachman1, Vergio V Effendy1, Muhammad H S Azmi1
1School of Life Sciences and Technology, Institut Teknologi Bandung, Bandung 40132, Indonesia.
ACS synthetic biology
|February 5, 2024
概括
针对SARS-CoV-2 Mpro 抑制剂,开发了一种使用大肠杆菌合成生物学的新查系统. 这个系统可以在较低的生物安全水平上进行药物查,识别潜在的抗病毒候选人,如萨基纳维尔.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 分子生物学分子生物学
- 合成生物学 合成生物学
背景情况:
- 由于COVID-19的流行,需要持续开发有效的抗病毒疗法.
- 生物安全水平高的实验室的有限可用性阻碍了对SARS-CoV-2的大规模药物查.
- 需要在较低的生物安全水平上运行的可访问的选系统.
研究的目的:
- 开发一种新的SARS-CoV-2主要蛋白酶 (Mpro) 基于二聚体的查系统 (DBSS).
- 在大肠杆菌中利用合成生物学为低生物安全水平的药物查平台.
- 为了验证DBSS在识别抗病毒化合物的有效性.
主要方法:
- 通过将SARS-CoV-2 Mpro与大肠杆菌BL21中的AraC调节蛋白的DNA结合域联系起来,构建了一个DBSS).
- 采用蛋白质建模和分子对接来预测萨基纳维尔与工程AraC-Mpro.pro.的结合.
- 通过检测萨基纳维尔的抑制活性,验证了DBSS测定,并在Vero E6细胞中证实了抗病毒作用.
主要成果:
- 在DBSS成功检测到萨基纳维尔的抑制活性对SARS-CoV-2 Mpro在4-10微克/毫升 (P ≤0.05) 的度.
- 蛋白质建模和对接表明,萨基纳维尔与AraC-Mpro.pro的单体和二元形式结合.
- 维罗E6细胞测定证实了saquinavir在确定度范围内的抗病毒活性.
结论:
- 开发的DBSS有效用于SARS-CoV-2 Mpro二分化抑制剂的初步查.
- 这种系统减少了对高生物安全水平设施的要求,使药物查更容易获得.
- DBSS提供了一种有价值的工具,用于识别针对SARS-CoV-2的新型抗病毒候选者.


