对转录组进行比较分析,并鉴定了参与R2R3-MYB候选基因的R2R3-MYB基因,这些基因参与了Rheum palmatum L中的 antraquinone生物合成
Xia Zhao1,2, Feng Yan1,2, Yi-Min Li3,4
1Key Laboratory for Research and Development of "Qin Medicine" of Shaanxi Administration of Traditional Chinese Medicine, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xianyang, 712046, China.
Chinese medicine
|February 5, 2024
概括
这项研究确定了关键的MYB转录因子,参与调节Rheum palmatum L.中的 antraquinone生物合成. RpMYB81显示了转录活性和核定位,表明其在药物化合物生产中的作用.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 药用植物基因组学 药用植物基因组学
- 二次代谢物生物合成 二次代谢物生物合成
背景情况:
- 莱棕 (Rheum palmatum L.) 是一个有价值的药用植物,因为它的 antraquinone 含量.
- 控制R. palmatum中氨酸生产的特定基因和转录因子 (TFs) 尚不清楚.
研究的目的:
- 识别和表征关键基因和参与R. palmatum中 antraquinone生物合成和调节的TFs.
- 阐明氨酸生产背后的监管机制.
主要方法:
- 转录组测序和差异性基因表达分析.
- 对R2R3-MYB家族基因的生物信息识别和表征.
- 在MeJA治疗后的同表达,蛋白相互作用和qRT-PCR分析.
- 为选择的MYB基因进行亚细胞局部化和交换活化试验.
主要成果:
- 28个差异表达基因 (DEGs) 在 antraquinone 途径中被确定.
- 11个基合成酶 (CHS) 基因和12个MYB基因显示出差异性的表达和潜在的相互作用.
- 52个MYB基因被确定为积极调节者;RpMYB81,RpMYB98和RpMYB100对MeJA治疗做出了反应.
- RpMYB81表现出核局部化和自我激活活动,将其与 antraquinone 生物合成调节联系起来.
结论:
- RpMYB81,RpMYB98和RpMYB100都是由MeJA显著诱导的.
- RpMYB81,局部存在于具有转录活性的核中,是R. palmatum中 antraquinone生物合成的潜在关键调节器.
