标准化数字生物库:整合成像,基因组和临床数据,用于精准医学
Valentina Brancato1, Giuseppina Esposito2,3, Luigi Coppola1
1IRCCS SYNLAB SDN, 80143, Naples, Italy.
Journal of translational medicine
|February 5, 2024
概括
数字生物库整合了各种生物医学数据,包括成像和下一代测序 (NGS),用于精确医学. 对于放射性和病态数据等特征,标准化挑战仍然存在,但基于JSON的模型提供了解决方案.
科学领域:
- 生物医学信息学 生物医学信息学
- 计算病理学计算病理学
- 无线电学 (Radiomics) 是一种无线电学.
背景情况:
- 来自临床成像,病理学和下一代测序 (NGS) 的异质生物医学数据正在增加.
- 准确医学的有效采用需要为研究和开发提供可访问和标准化的数据.
- 数字生物库可以促进数据共享,用于个性化诊断和预测建模.
研究的目的:
- 评估个别诊断领域的标准化状态.
- 确定数字生物库数据集成方面的挑战.
- 为整合多样化的生物医学数据提出解决方案.
主要方法:
- 分析生物银行和数字存储库数据标准化的最新情况.
- 识别标准化数值描述符 (放射性,病态性,性特征) 的挑战.
- 基于使用案例的JSON格式的整合模型建议.
主要成果:
- 对于个别的诊断领域存在参考标准.
- 跨领域整合和复制数值描述符的标准化是一个公开的挑战.
- 提出了一个基于JSON的集成模型来应对这些挑战.
结论:
- 数字生物库对于推进精准医学至关重要.
- 需要进行标准化努力,以确保数据适合集成和共享.
- 拟议的模型可以实现全面的疾病研究和数据驱动技术开发.
