开发一种廉价且准确的携带者查方法,用于发展中国家的脊髓肌肉缩
Yu Jiang1, Zhenyu Luo2, Wenrong Wang2
1United Diagnostic and Research Center for Clinical Genetics, Women and Children's Hospital, School of Medicine & School of Public Health, Xiamen University, Xiamen, Fujian, 361003, PR China; Biobank, Women and Children's Hospital, School of Medicine, Xiamen University, Xiamen, Fujian, 361003, PR China.
European journal of medical genetics
|February 7, 2024
概括
一种新的,低成本的双重滴滴数字PCR (ddPCR) 方法准确地选脊髓肌缩 (SMA) 载体. 这种可访问的方法可以改善人口携带者查,特别是在中国等发展中国家.
科学领域:
- 遗传学和分子生物学
- 医学诊断 医学诊断 医学诊断
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 脊髓肌肉缩 (SMA) 是一种严重的新生儿疾病,主要是由父母的生存运动神经元1 (SMN1) 基因的异构缺失引起的.
- 专业组织建议对所有夫妇进行经受孕性SMA携带者查,但其在中国的流行程度受到当前查方法限制的限制.
- 现有的方法面临成本,可访问性和广泛实施方面的挑战,阻碍了有效的人口查工作.
研究的目的:
- 开发一种具有成本效益,可访问和准确的SMA携带者查方法,使用双重滴滴数字PCR (ddPCR).
- 为了验证ddPCR试验的性能来确定SMN1拷贝数量及其与既有方法的一致性.
- 促进在包括中国在内的发展中国家进行更广泛的SMA携带者查.
主要方法:
- 开发双重滴滴数字PCR (ddPCR) 试验,用于量化SMN1基因拷贝数.
- 使用接收器操作特征 (ROC) 曲线分析来确定SMN1副本数量确定的最佳切断值.
- 在482个案例中验证了ddPCR试验的线性,精度 (在试验内和试验间) 和精度与多重结合依赖探针放大 (MLPA) 相比.
主要成果:
- ddPCR测定显示出极好的线性 (R2>0.99) 和高精度 (内部和内部测定<6.0%).
- ddPCR和MLPA之间的一致性很高,在482例中480例 (99.6%) 的结果一致.
- ddPCR测定实现了100%的样品整体正确分类,准确识别了SMN1复制号.
结论:
- 开发的双重ddPCR试验是一种低成本,高精度和可靠的SMA载体查方法.
- 确定适当的切断值对于使用ddPCR半定量确定SMN1副本数量至关重要.
- 这种ddPCR试验具有广泛应用在基于人口的SMA载体查计划中的巨大潜力,特别是在资源有限的环境中.
