一个工作流程,通过"博物馆收获"自然历史藏品来扩大DNA条形码参考库
Valerie Levesque-Beaudin1, Meredith E Miller1, Torsten Dikow2
1Centre for Biodiversity Genomics, University of Guelph, Guelph, Canada Centre for Biodiversity Genomics, University of Guelph Guelph Canada.
Biodiversity data journal
|February 8, 2024
概括
自然历史收藏对生物多样性知识至关重要. 一个精简的精简.
科学领域:
- 生物多样性科学是生物多样性的科学.
- 基因组学就是基因组学.
- 博物馆研究是博物馆研究.
背景情况:
- 自然历史收藏中包含了关于物种和生物多样性的重要数据.
- 数字化和DNA条形码对获取这些知识至关重要.
- 史密森尼国家自然历史博物馆拥有丰富的二科动物收藏.
研究的目的:
- 开发和优化一种工作流程,用于从自然历史藏品中编码DNA标本的条形码.
- 为了创建一个验证的,全球DNA条形码库Diptera.
- 为了证明博物馆衍生的DNA条形码对分类学分配的实用性.
主要方法:
- 开发了一个"博物馆收获"工作流程,用于Diptera标本.
- 工作流包括样本选择,标记,成像,组织采样,数据库和DNA条形码.
- 使用了桑格和下一代测序方法.
主要成果:
- 从100个国家的695个物种中,成功地通过DNA编码了941个凭证标本.
- 取得了88.8%的测序成功率,其中727个属获得了条形码> 300个基数对.
- 下一代测序有效地从100多年前的标本中恢复了条形码.
结论:
- 开发的工作流程有效地从博物馆标本中生成DNA条形码.
- 新生成的参考条形码有助于生物多样性数据的分类学分配.
- 这种方法提高了自然历史收藏的可访问性和用于科学研究的实用性.
