源附近的被动采样用于在大学住宅环境中监测病毒爆发
Kata Farkas1, Jessica L Kevill1, Latifah Adwan1
1School of Environmental and Natural Sciences, Bangor University, Bangor, UK.
Epidemiology and infection
|February 8, 2024
概括
源地附近的被动废水采样有效检测到学生住房中的SARS-CoV-2变种,流感A和肠道病毒. 这种方法为监测高密度社区的病原体循环提供了有价值的工具.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 基于废水的流行病学 (WBE) 对人口层面的病原体监测至关重要,特别是针对SARS-CoV-2.
- 现有的WBE方法主要集中在SARS-CoV-2上,对各种病毒的近源被动采样进行有限的调查.
- 学生宿舍是高风险的环境,因为人口密集和可能的快速疾病传播.
研究的目的:
- 评估源附近被动废水采样用于检测多种病毒的有效性.
- 评估这种方法在像学生大厅这样的高密度社区环境中的实用性.
- 为了调查SARS-CoV-2变种,流感病毒和肠道病毒的存在.
主要方法:
- 在四个学生宿舍地点,被动采样器在一夜之间 (17h) 和白天 (7h) 部署.
- 量化聚合酶链反应 (qPCR) 和下一代测序 (NGS) 用于病毒检测.
- 目标病毒包括SARS-CoV-2及其令人担忧的变体 (VOC),流感病毒和肠道病毒.
主要成果:
- 近源被动采样成功检测出使用qPCR和NGS的SARS-CoV-2变体.
- 在学生群体中发现了A型流感疫情.
- 检测到肠道病毒的零星爆发,包括肠道病毒D68和Coxsackievirus.
结论:
- 源附近被动采样是一种可行且有效的方法,用于检测废水中的多种病毒病原体.
- 这种方法为高密度社区的健康状况提供了有价值的见解.
- 该研究强调了下水道采样在积极的公共卫生监测中的潜力.
