对假鱼,Thaumatotibia leucotreta对高温和低温处理的反应进行比较转录组分析
Nelson L Mwando1, Fathiya M Khamis2, Shepard Ndlela2
1International Centre of Insect Physiology and Ecology, icipe, 30772-00100, Nairobi, Kenya; Leibniz Universität Hannover, Institute of Horticultural Production Systems, Sect. Phytomedicine - Applied Entomology, Herrenhäuser Strasse 2, D-30419 Hannover, Germany.
概括
这项研究揭示了假 (FCM) 在寒冷和热压力下发生的分子变化. 通过RNA测序确定了涉及热耐受性的关键基因,有助于害虫控制策略.
科学领域:
- 昆虫学 昆虫学是一门学科.
- 分子生物学分子生物学
- 虫害管理 虫害管理 虫害管理
背景情况:
- 假 (Thaumatotibia leucotreta) 是一个重要的隔离害虫,影响全球贸易.
- 有效的收获后控制依赖于了解昆虫对寒冷和热等植物卫生处理的反应.
- 在FCM中耐热性分子机制尚不清楚.
研究的目的:
- 通过使用RNA测序来研究thaumatotibia leucotreta幼虫对热应激的分子反应.
- 识别与耐寒和耐热相关的差异表达基因 (DEGs).
- 为未来关于FCM热适应的研究提供基础.
主要方法:
- 在Illumina HiSeq平台上进行RNA测序 (RNA-seq),以生成转录组资料.
- 不同基因表达分析比较了暴露在-10°C,0°C,25°C,40°C和50°C的幼虫.
- 基因本体学 (GO) 和基因和基因组 (KEGG) 京都百科全书对DEG注释的途径分析.
- 选择的DEGs的RT-qPCR验证.
主要成果:
- 转录组组件产生了226,067个转录和127,018个单基因.
- 在各种温度下发现了大量的DEG:874个在-10°C,91个在0°C,159个在40°C,754个在50°C,相对于25°C.
- 标注的DEG包括热冲击蛋白,细胞染色体P450s,皮质蛋白和参与代谢途径的基因 (胺,纯氨酸,叶酸,糖脂).
- 通过RT-qPCR确认了所选DEGs的表达模式.
结论:
- 这项研究提供了第一个在热应力下对FCM的综合差异基因表达分析.
- 鉴定的基因为FCM中耐寒耐热的分子基础提供了洞察力.
- 结果可以为开发针对FCM的新型有针对性的害虫防治策略提供信息.
