对Campylobacter spp.的分子表征 从泰国南部的商业肉和本土中采集的隔离物使用全基因组测序
Doan Hoang Phu1, Tuempong Wongtawan2, Phitchayapak Wintachai3
1Akkhraratchakumari Veterinary College, Walailak University, Nakhon Si Thammarat 80160, Thailand; Doctoral Program in Health Sciences, College of Graduate Studies, Walailak University, Nakhon Si Thammarat 80160, Thailand; Faculty of Animal Science and Veterinary Medicine, Nong Lam University, Ho Chi Minh City 70000, Vietnam.
这项研究描述了泰国的Campylobacter jejuni和大肠杆菌,揭示了遗传多样性和广泛的抗菌素耐药性. 关键发现包括普遍存在的耐药基因和突变,突出了对公共健康的风险.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 食品安全 食品安全
背景情况:
- 坎皮洛巴克特菌种是的主要储存体,导致人类的胃肠道感染.
- 低至中等收入国家的坎皮洛巴克特的基因组特征和抗菌素耐药性需要进一步调查.
研究的目的:
- 在泰国的Campylobacter分离物上进行全基因组测序.
- 为了识别序列类型,抗微生物耐药性基因和毒性因子.
- 为了比较基因组数据与参考Campylobacter序列.
主要方法:
- 21种Campylobacter jejuni和5种Campylobacter coli分离物的全基因组测序.
- 序列类型 (ST) 和抗菌素耐药性 (AMR) 基因的识别.
- 对毒性相关基因和单核酸多态 (SNP) 的分析.
主要成果:
- 在C. jejuni中确定了13个ST,在C. coli中确定了5个ST,其中ST 2274是突出的.
- 观察到广泛的抗菌素耐药性,包括所有分离物中的blaOXA,大多数C. jejuni和C. coli中的gyrA突变,以及高比例的tet(O).
- 确定了203个与毒性相关的基因,与参考基因组相比,发现了显著的SNP分歧.
结论:
- 这项研究加深了对Campylobacter spp.的理解. 泰国生产中的分子流行病学.
- 这些发现突显了该地区Campylobacter的遗传多样性和有关抗菌素耐药性概况.
- 这些数据对于为公共卫生战略和食品安全措施提供信息至关重要.
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