印度一些发酵食品中的乳酸细菌及其预测功能概况
Jyoti Prakash Tamang1, Pynhunlang Kharnaior2, Prakash M Halami3
1Department of Microbiology, School of Life Sciences, Sikkim University, Science Building, Dara Goan, Tadong, Gangtok, Sikkim, 737102, India. jptamang@cus.ac.in.
概括
研究人员从印度发酵食品中识别了五种乳酸细菌 (LAB) 菌株,如 sidra,kinema 和 dahi. 生物信息分析预测了它们的功能,揭示了这些有益细菌对健康的潜在益处的见解.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 食品科学 食品科学 食品科学
背景情况:
- 乳酸细菌 (LAB) 在发酵各种食品中至关重要.
- 印度发酵食品如 sidra,kinema 和 dahi 是各种微生物群落的丰富来源.
- 从这些传统食品中了解LAB的功能能力对于食品生物技术和健康非常重要.
研究的目的:
- 从印度发酵食品中分离和识别LAB菌株.
- 使用生物信息学工具预测这些LAB菌株的功能潜力.
- 探索与这些已识别的LAB相关的潜在促进健康的益处.
主要方法:
- 从 sidra,kinema 和 dahi 中隔离和识别LAB.
- 16S rRNA基因测序用于精确的细菌鉴定.
- PICRUSt2软件和KEGG数据库用于LAB基因组的预测功能分析.
主要成果:
- 鉴定了五种LAB菌株:乳球菌乳糖 (3种菌株) 和乳球植物菌植物菌 (2种菌株).
- 预测功能分析表明与新陈代谢 (36.47%),环境信息处理 (31.42%) 和遗传信息处理 (9.83%) 相关的基因.
- 预测了与膜运输 (29.25%) 和碳水化合物代谢 (11.91%) 相关的丰富基因.
结论:
- 已识别的LAB菌株具有与代谢和运输相关的多种功能基因.
- 这项研究为了解印度发酵食品中LAB的健康促进性质提供了基础.
- 像PICRUSt2这样的生物信息方法对于预测复杂的食物矩阵中的微生物功能是有价值的.
