在对Trichoderma atroviride的晚期反应中识别番茄微RNA
Rocío Olmo1, Narciso M Quijada1, María Eugenia Morán-Diez1
1Institute for Agribiotechnology Research (CIALE), Department of Microbiology and Genetics, University of Salamanca, 37185 Villamayor, Salamanca, Spain.
International journal of molecular sciences
|February 10, 2024
概括
特里科德玛阿特罗维里德的应用改变了番茄微RNA (miRNA) 配置文件,影响了植物防御途径. 小RNA表达的这些变化表明对番茄的长期影响.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 农作物科学 农作物科学
背景情况:
- 小RNAs (sRNAs),包括microRNAs (miRNAs),是真核生物中基因表达的关键调节者.
- 植物miRNA在抗病和应激反应中起着重要作用.
- 番茄 (Solanum lycopersicum) 作为研究植物压力的模型生物.
研究的目的:
- 为了研究Trichoderma atroviride对番茄植物miRNA特征的影响.
- 识别差异表达的miRNA及其潜在的基因.
- 了解这些miRNAs在植物防御中的功能作用.
主要方法:
- 高通量RNA测序,以在用Trichoderma atroviride治疗的番茄植物中分析小RNA.
- 实时定量PCR验证miRNA表达水平.
- 生物信息分析用于预测miRNA目标和相关代谢途径 (KEGG).
主要成果:
- 鉴定了10种不同表达的miRNA:五种上调和五种下调.
- 检测到7种已知的miRNA和3种假定新型miRNA.
- 分析预测了945个向基因,其中84%显示下调,主要涉及植物病原体相互作用,膜贩运和蛋白质激酶.
结论:
- 特里科德玛亚特罗维里德显著改变番茄miRNA的表达,影响植物的防御机制.
- 鉴定出差异表达的miRNA及其点与植物病原体相互作用有关.
- 这些由Trichoderma诱导的miRNA表达变化可能会对番茄植物防御产生长期影响.
