在撒哈拉以南非洲开发和验证艾滋病毒相关的密码球菌脑膜炎的定量PCR测定:一个诊断准确性研究
Tshepiso Mbangiwa1, Aude Sturny-Leclère2, Kwana Lechiile3
1Botswana-Harvard Health Partnership, Gaborone, Botswana; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Translational Mycology Group, Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques, Department of Mycology, Paris, France; Institute of Infectious Disease and Molecular Medicine, Department of Pathology, Faculty of Health Sciences, University of Cape Town, Cape Town, South Africa.
定量PCR (qPCR) 试验为检测和量化艾滋病毒相关的加密球菌脑膜炎的真菌负载提供了比传统方法更快的替代方案. 这些新型测试在监测治疗反应和识别Cryptococcus物种方面表现有前途.
科学领域:
- 临床微生物学 临床微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 与艾滋病毒相关的密码球菌脑膜炎是艾滋病相关死亡的主要原因.
- 目前用于评估真菌负荷的方法,如殖民地形成单位 (CFU) 计数,是劳动密集型和耗时的.
- 需要更快,更有效的诊断工具,以在资源有限的环境中进行患者管理.
研究的目的:
- 设计,优化和验证用于Cryptococcus检测和量化的定量PCR (qPCR) 试验.
- 评估qPCR在识别Cryptococcus物种和在治疗期间监测真菌负载方面的有用性.
- 为撒哈拉以南非洲的加密球菌脑膜炎管理提供快速诊断替代方案.
主要方法:
- 开发和验证特定物种 (QSP1) 和泛Cryptococcus (28S rRNA基因) qPCR测定.
- 在博茨瓦纳和马拉维对209名患有密码球菌脑膜炎的患者进行了长度研究,在基线,第7天和第14天分析脑脊液 (CSF).
- 将qPCR结果与量化加密球菌培养物作为参考标准进行比较.
主要成果:
- 与培养相比,28S rRNA和QSP1 qPCR测定均显示出高灵敏度 (分别为98.2%和90.4%).
- qPCR对真菌负荷的量化与定量培养有很好的相关性 (R2=0.78和R2=0.73,分别).
- 在两个研究地点都观察到*Cryptococcus neoformans*的占主导地位;在治疗后的10名患者中检测到可活但不能培养的酵母.
结论:
- QSP1和28S rRNA qPCR测定对于Cryptococcus物种识别和真菌负载量化是有效的.
- 在诱导疗法期间,qPCR测定提供了一个比培养更快的替代品,用于监测诱导疗法期间的真菌负载下降.
- 在治疗期间检测可活但不可培养的Cryptococcus的临床意义需要进一步调查.
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