在歌鸟大规模死亡事件期间检测病原体的元基因组学
Lusajo Mwakibete1, Sabrina S Greening2, Katrina Kalantar3
1Chan Zuckerberg Biohub, San Francisco, California 94158, USA.
Journal of wildlife diseases
|February 12, 2024
概括
野生动物大规模死亡事件可能是新出现的疾病的信号. 在美国东部对死亡鸟类的基因组测序没有发现任何单一的病原体,这表明进一步调查环境因素.
科学领域:
- 兽医病理学 兽医病理学
- 野生动物健康 野生动物健康
- 微生物学 微生物学
背景情况:
- 野生动物群体中的大规模死亡事件可以表明新出现的传染病.
- 在2021年,美国东部报告了数百只死去的流鸟,它们表现出神经和眼睛的迹象.
研究的目的:
- 调查美国东部鸟大规模死亡事件的原因.
- 评估高通量下一代元基因组测序在诊断野生动物疾病爆发中的实用性.
主要方法:
- 在三个实验室的受影响和未受影响鸟类样本上进行了高通量元基因组下一代测序.
- 分析了临床症状和诊断结果,以确定潜在的致病原体.
主要成果:
- 甲基因组分析检测到许多潜在的致病微生物,主要是细菌,但在受影响的鸟类中没有一个单一的病原体被始终确定.
- 许多检测到的微生物也存在于未受影响的对照鸟类中,表明亚临床感染或共生关系.
- 实验室之间一致的结果支持进一步调查非传染性原因,如环境污染物或营养不足.
结论:
- 甲基因组测序是调查野生动物死亡事件的宝贵工具,即使没有确定单一的传染病原体.
- 该研究为未来对新出现的野生动物疾病的调查提供了框架,并强调需要考虑多因素原因.


