在高通量PCR系统上对定量vanA/vanBDNA选试验的调整和验证

科学领域:

• 临床微生物学 临床微生物学
• 分子诊断学 分子诊断学
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 抗菌素的肠球菌 (VRE) 是导致医院感染的重要原因,特别是在重症监护室 (ICU).
• 肠道VRE殖民与传播概率和感染风险的增加有关.
• 准确量化VRE细菌负载对于评估感染风险和传播动态至关重要.

研究的目的:

• 开发和验证一个定量的vanA/vanB DNA实时PCR分析.
• 在高吞吐量系统上进行测试,以实现高效的VRE检测和量化.
• 评估试验的性能特征,包括检测极限,线性和预测值.

主要方法:

• 开发一种定量实时PCR测定方法,针对vanA和vanB基因.
• 使用连续细菌稀释来确定试验性能.
• 在不同样本类型 (直肠,缩) 中评估灵敏度和正预测值 (PPV).

主要成果:

• 该试验达到46.9dcp/ml (vanA) 和60.8dcp/ml (vanB) 的检测极限.
• 在广泛的细菌度范围内观察到出色的线性.
• 对于 vanA 和 vanB. 实现了高灵敏度 (100%). vanA PPV为100%,而vanB PPV在直肠拭子中为34.6%,在缩中增加到87.2%.
• 量化显示PCR阳性/培养负的样本中的中位数细菌负载为2.0×10^4dcp/ml,PCR阳性/培养阳性患者中的中位数细菌负载为9.1×10^4dcp/ml.

结论:

• 自动化vanA/B_UTC实时PCR测定可提供可靠的检测和量化VRE.
• 该试验适用于各种诊断环境,并可用于临床研究.
• 这种工具可能有助于阐明VRE细菌负载与感染和传播风险之间的关系.