使用氧胺连续提取蛋白质,以增加新鲜,法医和考古骨中蛋白质覆盖的深度
Catherine Gilbert1,2, Katell Bathany1,2, Stéphane Claverol2
1Université de Bordeaux, CNRS, Bordeaux INP, CBMN, UMR 5248, F-33600 Pessac, France.
Analytical chemistry
|February 13, 2024
概括
这项研究引入了一种新的蛋白质组学方法,用于分析古代和现代的骨和牙样本. 化学消化协议增强了蛋白质识别和序列覆盖,为原和细胞外矩阵蛋白提供了新的见解.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 考古学测量是指考古学测量的方法.
- 古蛋白质组学是古蛋白质组学.
背景情况:
- 蛋白质组学越来越多地应用于各种样本类型,包括古老的生物材料.
- 对骨和牙等含有原蛋白的组织的分析在蛋白质组学中提出了独特的挑战.
研究的目的:
- 为新鲜,解剖和考古样品提供和评估基于化学消化的蛋白质组学样品准备协议.
- 证明氧胺在增强矿物化组织蛋白质组分析中的实用性.
主要方法:
- 开发和应用两个不同的蛋白质组学样本准备协议,包括化学消化和xylamine处理.
- 使用开发的协议,分析新鲜的,解剖学和考古骨和牙样本.
主要成果:
- 这两种协议都显著增加了序列覆盖率和现代和考古样本中检测到的的数量.
- 在使用增强协议的考古样本中观察到识别的蛋白质数量的增加.
- 对不溶性分数或非矿物化组织施加的氧胺治疗,产生了额外的蛋白质信息.
结论:
- 描述的基于化学消化的蛋白质组学协议,特别是包含氧胺的蛋白质组协议,对于分析富含原蛋白的组织是有效的.
- 这些方法可以更深入地了解最近和古代矿物样本中的蛋白质组.
- 这种方法有望在各种生物环境中推进对原体和细胞外矩阵蛋白的研究.


