来自果来源收集的果树耐药和易受果树的转录组概况
Jordan Brungardt1, Yanina Alarcon2,3, Jason Shiller2,4
1USDA-ARS, Byron, GA, USA.
BMC genomics
|February 14, 2024
概括
这项研究确定了坚果果抗性候选基因. 了解这些基因可以改善疾病管理,并开发更耐用的坚果品种来对抗Venturia effusa.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子遗传学 分子遗传学
- 园艺科学 园艺科学
背景情况:
- 由Venturia effusa引起的花生皮严重损害花生作物,需要频繁的杀菌剂应用.
- 杀菌剂的使用带来了成本,促进了耐药性,目前耐药的品种通常会被病原体的适应所克服.
- 有限的知识存在于分子基础的遗传耐受性对坚果.
研究的目的:
- 阐明自然甲抗性背后的分子机制.
- 为了识别耐药与易受果树中差异表达的基因.
- 为了为培育更耐用的耐果品种提供基础.
主要方法:
- 在自然感染条件下,对耐药和易受感染的树木果叶样本的RNA测序数据的分析.
- 在敏感树木中,疾病和非疾病组织之间的基因表达特征的比较.
- 根据三个季节的 rating,选择了十棵耐药和十棵易受伤害的树木.
主要成果:
- 在没有疾病的耐药树和易感树之间,有313个基因被差别表达.
- 在患病与未患病的敏感组织中,有1454个基因被差异地表达.
- 与病原体识别和防御相关的基因在患病的敏感组织中被上调;耐药组织中的基因通常被下调.
结论:
- 这项研究介绍了第一批参与在自然果园条件下坚果抗性和易感性的候选基因.
- 这些发现为子育种计划提供了宝贵的见解,旨在提高皮的抗性.
- 这项研究支持开发生物技术方法,以创造具有耐久性抵抗Venturia effusa的坚果品种.


