旧的工具,新的应用:使用环境菌体进行伤寒监测和评估疫苗影响

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 传染病流行病学 传染病流行病学
• 分子诊断学 分子诊断学

背景情况:

• 由沙门氏菌Typhi引起的伤寒热在流行地区造成了严重的健康负担.
• 传统的沙门氏菌血培监测是昂贵的,对于大规模实施来说是不可持续的.
• 伤寒结合疫苗 (TCV) 是一个有希望的干预措施,需要准确的疾病负担数据来制定有效的政策.

研究的目的:

• 评估表面水中 Typhi 特定细菌监测作为检测沙门氏菌 Typhi 循环的低成本工具的有效性.
• 在城市 (达卡) 和农村 (米尔扎普尔) 孟加拉国,比较沙门氏菌型菌的流行率.
• 评估环境菌体检测和培养确认的伤寒病例之间的相关性.

主要方法:

• 2021年从孟加拉国达卡和米尔扎普尔收集了环境水样.
• 样本被测试是否存在沙门氏菌Typhi特定的菌菌体.
• 在当地医院通过血液培养确认了伤寒发烧病例.
• 孤立的菌体因其对各种沙门氏菌Typhi基因型的杀伤谱而具有特征.

主要成果:

• 在达卡31%的样本中检测到沙门氏菌 Typhi 特定的菌体,而在米尔扎普尔的样本中则为3%.
• 与米尔扎普尔 (0.05%) 相比,达卡的伤寒发烧发病率明显高 (5%).
• 大多数 (75%) 的阳性菌体样本是从污水中回收的,孤立的菌体显示出多样化的杀死谱.

结论:

• 环境菌体监测显示,与伤寒发烧负担有很强的关联,城市地区的检测率更高.
• 这种方法提供了传统监测的成本效益高的替代方案,用于识别沙门氏菌Typhi热点.
• 环境菌体检测可以帮助决策者制定有针对性的伤寒控制和疫苗接种战略.