在蚊子池中自动分子检测西尼罗河病毒,使用潘瑟融合系统
1District of Columbia Department of Forensic Sciences, Public Health Laboratory Division, Immunology and Virology Unit, 401 E Street SW Washington, DC 20024, USA.
Journal of virological methods
|February 15, 2024
概括
西尼罗病毒 (WNV) 监测通过一种新的自动化测试来加强. 在Panther融合系统上,这种优化的多重检测方法在蚊子池中提供了准确的,高通量WNV检测.
科学领域:
- 医学昆虫学 医学昆虫学
- 分子诊断学 分子诊断
- 公共卫生监督 公共卫生监督
背景情况:
- 西尼罗病毒 (WNV) 是美国的一种重要的树冠病毒性疾病,主要由蚊子传播.
- 目前的WNV监测依赖于劳动密集型RT-qPCR方法.
- 自动化平台为更高效的实验室开发测试 (LDT) 提供了潜力.
研究的目的:
- 为了优化和验证WNV多重体LDT在Panther融合系统上.
- 为了使蚊子群体中WNV的高通量环境监测成为可能.
- 评估自动化测试的分析灵敏度和性能.
主要方法:
- 开发和优化针对ENV和NS1基因的WNV多重体LDT.
- 利用 Panther 融合系统的开放访问功能进行自动核酸提取,RT-qPCR和结果生成.
- 测试80个蚊子池,包括先前测试的和的样本,以评估测试性能.
主要成果:
- 在WNV LDT中,ENV的分析灵敏度为186副本/PCR,NS1.1的分析灵敏度为744副本/PCR.
- 当与CDC WNV RT-qPCR测定对60个先前测试的池进行比较时,观察到100%的阳性和阴性一致性.
- 测试成功检测出所有20个的蚊子池.
结论:
- 融合WNV LDT成功开发和优化用于高通量环境监控.
- 该自动化测试的性能与已建立的CDC WNV RT-qPCR测试具有可比性.
- 这种优化的LDT为WNV蚊子监测提供了有效的解决方案.


