对有症状的苦果植物进行的转录组分析揭示了混合病毒感染与假定的新型波莱罗病毒

科学领域:

• 植物病毒学 植物病毒学
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 下一代测序 (NGS) 和生物信息学对于发现新型病毒基因组至关重要.
• 在伊朗的苦果植物 (Citrullus colocynthis) 显示矮化,缩和化,取样进行分析.

研究的目的:

• 在有症状的苦果植物中识别和描述病毒病原体.
• 确定已识别的病毒的基因组组织和遗传学关系.

主要方法:

• 叶子样本经过NGS进行病毒检测.
• 使用de novo组合和BLAST分析来识别病毒序列.
• 完整和部分病毒基因组被组装和表征.

主要成果:

• 他们组装了花脉黄化病毒 (SqVYV),类相关性狂犬病病毒 (CiaRV) 和一种新型的波莱罗病毒 (Bitter apple aphid-borne yellows virus (BaABYV)) 的完整基因组.
• 还确定了西瓜马赛克病毒 (WMV) 的部分基因组.
• BaABYV表现出基因组组织和蛋白质身份,表明它是一个新的Polerovirus成员;在BaABYV和WMV中发现了重组.

结论:

• 红色合合合植物 (Citrullus colocynthis) 作为多种植物病毒的宿主库.
• BaABYV被提议作为Polerovirus属中的一种新物种.
• 在伊朗首次报告了类相关的狂犬病病毒 (CiaRV).