对自然产品进行虚拟选,以准泛素特异性蛋白酶7为目标
Hongju Li1, Yujie Sun2, Hua Yin3
1College of Food Science and Engineering, Ocean University of China, Qingdao, China.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|February 16, 2024
概括
三种天然产品被确定为乌比基特异性蛋白酶7 (USP7) 的强有力的抑制剂,这是癌症治疗的关键标. 这些化合物激活MDM2-P53通路,促进癌细胞亡,并为新的抗结肠癌药物开发提供潜力.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 乌比基特异性蛋白酶7 (USP7) 是癌症治疗的有效标,因为它在调节关键细胞通路中的作用.
- 抑制USP7可以触发MDM2-P53信号级联,导致癌细胞死亡 (亡).
研究的目的:
- 从天然产品库中识别新的USP7抑制剂.
- 评估已识别的化合物在调节癌细胞信号通路中的有效性.
- 研究化合物与USP7.7.的分子相互作用.
主要方法:
- 虚拟选利用3760种天然产品的分子对接,与USP7.7.相对应.
- 用于验证USP7抑制活性的酶和动力分析.
- 基于细胞的测试,以评估HCT116细胞中的MDM2和p53通路调节.
- 模拟分子动力学以阐明结合机制.
主要成果:
- 三种天然产品,Scutellarein (Scu),semethylzeylastera (DML) 和盐酸C (SAC),被确定为USP7抑制剂.
- 确定了IC50值:Scu (3.017微米),DML (6.865微米) 和SAC (8.495微米).
- 这些化合物对USP7的抑制导致MDM2下调和HCT116细胞中的p53通路激活.
- 分子动力学揭示了Scu和USP7残留物之间的稳定相互作用 (Val296,Gln297,Phe409,Tyr465,Tyr514).
结论:
- 斯库特拉莱因,塞米泽拉斯特拉和沙尔维阿诺酸C是有效的USP7抑制剂.
- 这些天然产品显示出开发新型抗癌疗法,特别是结肠癌的化合物的潜力.
- 已识别的化合物调节MDM2-P53通路,支持它们的治疗相关性.
