通过RNA导向的DNA甲基化突变体减少了对转基因玉米增强剂1增强剂的基因组甲基化
Iris Hövel1, Rechien Bader1, Marieke Louwers1,2
1Swammerdam Institute for Life Sciences, Universiteit van Amsterdam, P.O. Box 1210, 1090 GE Amsterdam, The Netherlands.
玉米中的基因突变涉及遗传性沉默转移. MOP基因的突变会影响增强器1位点的组分离子修饰和增强剂活性,这表明MOP因子可能会调解组分离子而不是DNA甲基化.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因规则 基因规则
背景情况:
- 参突变是一种独特的表观遗传现象,其中一个等位基因遗传地使另一个等位基因沉默.
- 在玉米中,助推器1 (b1) 位点的偏变涉及RNA导向DNA甲基化 (RdDM) 路径组件,如MOP1,MOP2和MOP3.
- 这些MOP基因的突变破坏了基因变异并释放沉默.
研究的目的:
- 调查mop1,mop2和mop3突变对玉米b1位点的染色质结构和DNA甲基化的影响.
- 阐明MOP因子在调节b1增强剂和表达中的作用.
- 为了确定MOP因子是否介导RNA导向的DNA甲基化或基因素修饰.
主要方法:
- 在mop1,mop2和mop3突变体中分析染色质修饰 (H3K9me2,H3K27me2).
- 增强剂活性和DNA甲基化 (CG,CHG,CHH) 在b1调控七次重复的评估.
- 在突变背景下评估b1基因表达水平.
主要成果:
- mop1和mop3突变导致H3K9me2和H3K27me2的减少,增强增强器功能,多循环结构和增加b1表达.
- mop2突变者保留了H3K9me2,H3K27me2的野生类型水平,以及单循环结构,没有升高的b1表达.
- 在所有突变物体中,高CG和CHG甲基化在b1 hepta-repeat持续存在,而CHH甲基化仍然很低.
结论:
- MOP因子在调节b1位点染色质和表达方面发挥着不同的作用.
- 数据表明,MOP因子可能会在b1位点中调解RNA导向的基因素甲基化,而不是DNA甲基化.
- 这挑战了RdDM的普遍模式,认为RdDM是这个位置上唯一的变异机制.
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