用于患者衍生器官的功能分析,用于精密瘤学的协议
Niloofar Nemati1, Nina Boeck1, Giorgia Lamberti1
1Biocenter, Institute of Bioinformatics, Medical University of Innsbruck, 6020 Innsbruck, Austria.
STAR protocols
|February 17, 2024
概括
这项研究概述了功能精确瘤学的协议,通过培养患者的瘤细胞和免疫细胞进行多组体分析来实现个性化癌症治疗.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 功能精确瘤学为个性化癌症治疗提供了一个有前途的途径.
- 扰乱原发性瘤细胞是了解个体瘤生物学的关键.
研究的目的:
- 为产生和培养来自患者的结直肠器官,瘤透淋巴细胞 (TILs) 和外周血液单核细胞 (PBMCs) 提出一个全面的协议.
- 为了实现包括RNA测序 (RNA-seq),全外体测序 (WES),单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和 (基-) 蛋白质组学在内的多组学分析.
主要方法:
- 来自患者的结直肠器官的生成和培养.
- 瘤透淋巴细胞 (TILs) 的隔离和扩张.
- 隔离和培养周围血液单核细胞 (PBMCs).
主要成果:
- 该协议有助于生成适用于综合多omics分析的样本.
- 能够对患者瘤和相关免疫细胞进行详细的分子分析.
结论:
- 该协议为功能精确瘤学研究提供了一种标准化的方法.
- 促进在个性化癌症治疗中进行多omics研究的高质量样本的生成.
