在现实世界的临床实践中,利用元基因组下一代测序来检测和诊断下呼吸道感染的病原体
Tangfeng Lv1, Qi Zhao2, Jia Liu3
1Department of Respiratory and Critical Care Medicine, Jinling Hospital, Nanjing University School of Medicine, Nanjing, 210002, Jiangsu, China.
Infection
|February 17, 2024
概括
与传统方法相比,甲基因组下一代测序 (mNGS) 显著改善了在下呼吸道感染 (LRTI) 中的病原体检测. 这种先进的技术有助于指导疑似LRTI患者的有效治疗决策.
科学领域:
- 临床微生物学 临床微生物学
- 传染病 传染病 传染病
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 传统的微生物学测试 (CMT) 在识别下呼吸道感染 (LRTI) 的传染病因方面面临挑战.
- 大基因组下一代测序 (mNGS) 提供了全面的病原体识别,包括难以培养的生物.
研究的目的:
- 评估mNGS在疑似LRTIs中的诊断和治疗效用.
- 为了在LRTIs中检测病原体,将mNGS与CMT进行比较.
- 评估mNGS引导的治疗调整对患者结果的影响.
主要方法:
- 分析了201名怀疑LRTIs的患者的205个临床样本,并行使用mNGS和CMTs.
- 利用mNGS结果指导CMT结果为负的患者进行治疗调整.
- 在接受mNGS引导治疗的患者中评估治疗疗效.
主要成果:
- mNGS在91.7%的样本中检测到微生物,明显高于CMT (37.6%).
- mNGS显示出高灵敏度 (总体93.5%,BALF样本95.4%). mNGS显示出高灵敏度 (总体93.5%,BALF样本95.4%).
- 以mNGS为指导的治疗在67.4%的患者中有效,最初CMT结果为负.
结论:
- mNGS是识别LRTIs中临床显著微生物的宝贵工具.
- mNGS提供了快速的周转时间,并且受到先前的抗菌药物管理的影响较小.
- mNGS支持疑似LRTIs的诊断和治疗决策.
