MEA-NAP比较了有机或单层神经元培养中的微尺度功能连接,拓和网络动态
Timothy Ph Sit1,2, Rachael C Feord1, Alexander We Dunn1
1Physiology, Development & Neuroscience, University of Cambridge, Cambridge, UK.
bioRxiv : the preprint server for biology
|February 19, 2024
概括
我们开发了MEA-NAP,这是一个MATLAB管道,用于从微电极阵列 (MEA) 记录中分析神经网络动态. 该工具揭示了神经元培养物和有机体中的微尺度功能连接和网络拓.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 计算神经科学是一种神经科学.
- 系统神经科学 系统神经科学
背景情况:
- 微电极阵列 (MEA) 记录对于研究神经元培养至关重要,它提供了对发射率,爆发模式和微尺度功能连接的见解.
- 从MEA数据中分析网络拓和动态对于了解跨规模的大脑功能至关重要,但计算工具有限.
研究的目的:
- 引入 MATLAB MEA 网络分析管道 (MEA-NAP),这是一个用于从 MEA 记录中分析微尺度功能性大脑网络的新型计算工具.
- 在各种神经元培养模型中实现网络拓,节点绘图和维度的详细表征.
主要方法:
- MEA-NAP处理来自单井或多井MEAs的原始电压时间序列数据.
- 它使用基于模板的尖峰检测用于多个单元的活动和概率值来识别重要的功能连接.
- 将规范化技术集成为可靠的网络比较.
主要成果:
- MEA-NAP成功应用于3D人类大脑器官和2D人类衍生或小鼠培养物.
- 管道揭示了不同的网络开发模式,包括拓学的差异,节点绘图和维度.
- 已证明能够检测药理干扰和疾病突变的网络级影响.
结论:
- MEA-NAP提供了一个全面的计算框架,用于从MEA数据中分析微观神经网络属性.
- 这种工具有助于研究神经发育,网络动态以及遗传或药理干预的影响.
- MEA-NAP 作为神经学研究中机理性见解和治疗查的翻译平台.
关键词:
微电极阵列是一个微电极阵列.减少维度,减少维度.功能连接性的功能连接性图形理论中的图形理论.人类大脑有机体诱导多能干细胞 (iPSC) 衍生的神经元多个单元的尖峰检测检测.网络动态 网络动态网络拓学 网络拓学神经元培养是一种神经元培养.节点地图学 节点地图学概率学值 概率学值 概率学值峰值时间 瓦片系数更多相关视频
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