在精密医学中对ex vivo样品处理的功能和分子影响的划分
Nona Struyf1, Albin Österroos2, Mattias Vesterlund3
1Department of Oncology-Pathology, Karolinska Institutet, Science for Life Laboratory, Stockholm, Sweden. nona.struyf@ki.se.
NPJ precision oncology
|February 19, 2024
概括
样本处理显著影响急性髓性白血病 (AML) 研究. 生物银行改变了细胞表型和药物反应,影响了翻译研究的可复制性,需要仔细的标准化.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 翻译性瘤学是指翻译性瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 翻译研究中的可复制性在很大程度上依赖于一致的样本处理.
- 生物银行程序可以在分子和功能测试中引入变异性.
- 急性髓性白血病 (AML) 研究需要强有力的数据,以获得有效的治疗方法.
研究的目的:
- 评估样本生物储存对高通量功能药物测试,蛋白质组学和AML的流细胞计的影响.
- 为了识别因样本处理而导致的细胞表型和药物反应的特定变化.
- 评估这些变化对翻译研究可复制性的影响.
主要方法:
- 对229名急性髓性白血病 (AML) 患者样本的分析.
- 新鲜与生物银行 (冷) 样本的比较.
- 高通量功能性药物测试. 高通量功能性药物测试.
- 基于质谱的蛋白质组学.
- 流量细胞计分析.
主要成果:
- 生物银行导致CD117 (c-KIT) 阳性髓状细胞减少,颗粒性AML细胞数量减少.
- 蛋白质表达水平和药物敏感性 (向增殖,新陈代谢,铁氨酸激酶,BH3模仿剂) 被生物银行改变.
- 结样本在药物敏感性得分中引入了系统错误,影响了个体水平的药物反应概况.
结论:
- 样品处理,特别是冷,显著影响AML细胞表型,蛋白质表达和药物敏感性.
- 生物银行协议的标准化对于改善翻译性AML研究的可复制性至关重要.
- 来自生物银行队列的数据的验证对于减轻潜在的系统错误和确保可靠的研究结果至关重要.


