非侵入性口腔样品的表征和核酸隔离用于分子诊断
Leonie Hose1, Matthias Schürmann2, Inga Mennebröcker2
1Department of Otolaryngology, Head and Neck Surgery, Campus Klinikum Bielefeld Mitte, University Hospital OWL of Bielefeld University, Teutoburger Str. 50, 33604, Bielefeld, Germany. leonie.hose@uni-bielefeld.de.
Scientific reports
|February 20, 2024
概括
这项研究开发了一种强大的分子诊断方法,使用非侵入性口腔抹布和口水进行核酸分析. 优化的协议产生了稳定的DNA/RNA,适用于口腔喉诊断的下游应用.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 分子诊断对于例行临床采样至关重要.
- 需要使用非侵入性采样方法从口腔/喉区域收集核酸.
研究的目的:
- 评估口腔抹布和口水作为核酸采样的非侵入性方法.
- 建立一个优化的工作流程,用于分子分析口腔/喉样本.
- 从这些样本中鉴定核酸的细胞,纯度,降解和微生物含量.
主要方法:
- 采用口腔抹布和口水收集样本 (n=59).
- 从采样到RT-qPCR分析的工作流程的开发.
- DNA/RNA的表征,包括细胞组成,纯度,降解和微生物含量.
- 确定RT-qPCR的最佳家庭基因.
主要成果:
- 与口腔抹布相比,口腔清洗产生的免疫细胞和细菌比例更高.
- 在协议优化后获得了稳定的DNA/RNA数量.
- DNA/RNA纯度在方法之间是可比的;RNA显示降解,但保留了测序潜力.
- 塔塔盒结合蛋白被确定为最适合的家政基因.
结论:
- 开发了一种强大的分子诊断方法,使用非侵入性口腔/喉取样 (擦拭物和口水).
- 该协议适用于各种下游诊断技术和微生物RNA分析.
- 这种方法作为一个基础,用于推进分子诊断在口腔腔腔.
