七种基因型的可可豆转录组概况识别了与透后对Phytophthora palmivora耐药性相关的特征

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 植物虫 (Phytophthora palmivora) 导致可可 (Theobroma cacao) 中的黑豆腐,严重影响作物产量.
• 了解可可对P. palmivora透后的分子反应对于开发耐药品种至关重要.
• 目前关于可可果对抗这种虫的防御机制的知识是有限的.

研究的目的:

• 为了全面探索可可果对P. palmivora感染的转录反应.
• 识别与透后抗性相关的可可基因,促进因子和 cis 调控模块.
• 为培育P. palmivora耐药可可提供资源.

主要方法:

• 疾病发展测定和RNA-Seq对7种不同于P. palmivora耐药性的可可基因型进行了测试.
• 差异基因表达分析和基因相关性网络建设.
• 在促进区域中发现新的动机发现和cis-regulatory模块识别.

主要成果:

• 可可的基因型被归类为对P. palmivora敏感或耐药.
• 数以千计的差异表达基因被确定,基因型之间存在显著的差异.
• 发现了与防御反应相关的新型促进因子和17个候选 cis-regulatory 模块.
• 在所有基因型中,一个特定的基因组 (6组) 被上调,在耐药基因型中显示出更高的诱导.

结论:

• 这项研究阐明了P. palmivora感染期间可可豆的复杂转录景观.
• 已经确定了赋予透后耐药性的关键基因,动机和调控元素.
• 这些发现为标记器辅助选择和旨在增强可可病耐药性的育种计划提供了宝贵的遗传资源.