MiniRead:一个简单而便宜的DIY设备,用于多次分析微生物生长动力学
Matthieu Falque1, Aurélie Bourgais1, Fabrice Dumas1
1GQE-Le Moulon, Université Paris-Saclay, INRAE, CNRS, AgroParisTech, Gif-sur-Yvette, France.
Yeast (Chichester, England)
|February 21, 2024
概括
研究人员开发了一种价格实惠的,DIY 96井流度计,MiniRead,用于监测微生物生长动力学. 这种设备与R包配对,简化了对增长参数的分析,如滞后时间和最大增长率.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 生物技术是生物技术.
- 生物工程是生物工程.
背景情况:
- 用光学密度测量的生长参数来评估微生物的健康状况.
- 高通量微生物生长监测通常受多通道光谱仪的成本限制.
- 目前用于同时监测多个96井板的现有方法对许多研究环境来说是预算上的限制.
研究的目的:
- 为了介绍一个低成本的,DIY (DIY) 96井温度控制的度计,命名为MiniRead.
- 为微生物生长动力学的自动化分析提供附带的R包.
- 为了使微生物生长参数的可访问,高通量监测.
主要方法:
- 开发了MiniRead设备,这是一个96通道的流度计,用于测量液体培养物中的光散射和吸收.
- 集成温度控制器用于精确的实验条件.
- 在micro-SD卡上自动记录数据,方便数据传输.
- 创建了一个R包用于非线性校准和生长动力学分析.
主要成果:
- MiniRead设备成功地在长时间内测量了96孔板的度.
- 该R包准确计算校准曲线,将度读数转换为细胞度.
- 实现了关键生长参数 (延迟时间,最大生长率,平原度) 的自动估计.
结论:
- 迷你阅读设备为高通量微生物生长监测提供了一个廉价和有效的解决方案.
- 综合的R包简化了微生物生长动态的分析,使其更容易获得.
- 该系统使研究人员能够在没有重大预算限制的情况下研究微生物健康和生长动态.
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