对扩张性心肌病中差异表达的基因和miRNA表达特征的综合分析
Yu Chen1, Wen-Ke Cai2, Jie Yu2
1Department of Cardiology, 920th Hospital of Joint Logistics Support Force, PLA, Kunming, China.
Heliyon
|February 22, 2024
概括
本研究使用生物信息学和临床验证确定了与扩张性心肌病 (DCM) 相关的关键基因和microRNAs (miRNAs). 这些发现为DCM提供了潜在的诊断和治疗点.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 心血管研究研究心血管研究
背景情况:
- 扩张性心肌病 (DCM) 是一种常见的心脏病,其分子基础不明.
- 识别与DCM相关的基因,途径和microRNA (miRNAs) 对于理解其病变发生至关重要.
- 生物信息学与临床验证相结合,提供了一种有前途的方法来发现DCM机制.
研究的目的:
- 识别和验证与扩张性心肌病 (DCM) 相关的基因,途径和miRNA.
- 阐明驱动DCM病原和进展的分子机制.
- 发现DCM的潜在诊断和治疗点.
主要方法:
- 使用基因本体学 (GO) 和KEGG通路丰富的3个mRNA数据集和1个miRNA数据库的分析.
- 蛋白与蛋白相互作用 (PPI) 和miRNA-mRNA调节网络的构建.
- 在临床样本中通过qRT-PCR和ROC分析验证差异表达的miRNA (87 DCM,83 Normal).
主要成果:
- 确定了78个差异表达的基因 (DEG) 和170个与DCM相关的差异表达的miRNA (DEM).
- 顶级GO注释包括细胞外矩阵和炎症反应;丰富的KEGG通路涉及神经和Wnt信号传递.
- 在PPI中发现了10个枢纽基因,8个枢纽基因和15个调节网络中的miRNA,其中13个miRNA显示出高临床诊断价值 (AUC>0.9).
结论:
- 这项研究为扩张性心肌病 (DCM) 的分子机制提供了新的见解.
- 已识别的基因,途径和miRNAs代表了DCM诊断和治疗的潜在目标.
- 临床验证证实了特定miRNAs在DCM检测中的实用性.
