在缺血性中风患者中确定缺氧和免疫相关的生物标志物
Haofuzi Zhang1, Jidong Sun1, Peng Zou1
1Department of Neurosurgery, Xijing Hospital, Fourth Military Medical University, Xi'an, China.
Heliyon
|February 22, 2024
概括
这项研究确定了四个关键基因 (FOS,DDIT3,DUSP1,NFIL3),与缺氧和缺血性中风 (IS) 的免疫反应有关. 这些生物标志物为诊断和治疗IS提供了新的途径.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 缺血性中风 (IS) 病理生理学涉及免疫微环境和缺氧之间的复杂相互作用.
- 识别与这些因素相关的特定生物标志物对于理解IS进展至关重要.
研究的目的:
- 为了确定缺氧和免疫相关的缺血性中风 (IS) 的生物标志物.
- 根据已识别的生物标志物开发IS的诊断模型.
主要方法:
- 对IS微阵列数据集GSE16561进行生物信息学分析,以寻找差异表达基因 (DEG).
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 来识别与免疫相关的基因.
- 蛋白与蛋白相互作用 (PPI) 网络构建以找到枢纽基因.
- 使用最小绝对收缩和选择操作员 (LASSO) 物流回归的诊断模型的开发.
主要成果:
- 确定了4171个DEG,45个差异表达的缺氧相关基因 (DEHRG) 和27个与免疫相关的DEHRG.
- 在IS和对照样本之间,在十种免疫细胞类型中发现了显著的透差异.
- 确定了FOS,DDIT3,DUSP1和NFIL3作为关键的枢纽基因.
- 在验证和培训队列中,AUC值分别为0.9188和0.9395的高诊断准确性.
结论:
- 验证了FOS,DDIT3,DUSP1和NFIL3作为可能参与IS病理发展的枢纽基因.
- 这些已识别的生物标志物为IS诊断和治疗策略提供了新的见解.
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