AnnoSM:一种自动化的注释工具,用于根据特有的MS/MS碎片离子库来确定父骨架上的替代模式
Xing Wang1, An-Qi Guo1, Rui Wang1
1State Key Laboratory of Natural Medicines, China Pharmaceutical University, No. 639 Longmian Dadao, Nanjing 211198, China.
这项研究介绍了AnnoSM,一种使用MS/MS数据的自动化方法,用于识别flavonoid分子上的替代物位置. 该软件在区分异构体和注释复杂的天然产品混合物方面实现了高精度.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 计算化学的计算化学
- 自然产品化学 自然产品化学
背景情况:
- 质谱 (MS) 对于小分子结构阐明至关重要,但在复杂样品中难以与异构体差异化作斗争.
- 精细分子结构的自动解释,特别是替代物模式 (SMs),在基于MS的分析中仍然是一个重大挑战.
研究的目的:
- 使用MS/MS数据开发一种自动化方法,用于识别使用MS/MS数据在黄骨架上的替代物模式 (SMs).
- 创建用户友好的软件AnnoSM,以协助研究人员进行自动化结构注释.
- 为了验证该方法的准确性和适用于复杂的自然产品矩阵的适用性.
主要方法:
- 基于特有的MS/MS碎片离子库的自动注释方法的开发.
- 利用黄,黄醇和异黄作为方法开发的模型化合物.
- 为计算非专家构建了名为AnnoSM的用户友好的软件.
主要成果:
- 在148个正宗的黄类固体标准上获得了76.87%的top-1准确度.
- 成功分化了22组黄类异构体. 成功分化了22组黄类异构体.
- 在 * Ginkgo biloba * 提取物中注释了331种可能的黄类与 SM 候选物,其中23种经过标准验证,13种正确的 SM 排名第一.
结论:
- 开发的基于MS/MS的自动化方法和AnnoSM软件有效地识别了flavonoid骨架上的替代模式.
- 该方法显示出高精度和适用于复杂的生物矩阵,有助于自然产品的结构分析.
- AnnoSM软件为研究人员提供了有价值的工具,并有可能推断到其他化合物类别.
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