对于一个具有挑战性的目标进行共识选:寻找P-糖蛋白抑制剂
Paolo Governa1,2, Marco Biagi3, Fabrizio Manetti2
1Department of Integrative Structural and Computational Biology, Scripps Research Institute La Jolla CA 92037 USA pgoverna@scripps.edu forli@scripps.edu.
研究人员选了天然化合物,以找到P-glycoprotein (P-gp) 抑制剂. 六种化合物显示出显著的P-gp抑制,IC50值低于5μM,为药物开发提供了新的支架.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 药理学和药物发现
背景情况:
- ATP结合盒 (ABC) 载体,特别是P-糖蛋白 (P-gp),对于膜运输和药物处置至关重要.
- P-gp调解了外生菌的流量,影响了药物的吸收,分布,新陈代谢和分泌 (ADME) 特性.
- 抑制P-gp可以增强药物疗效,克服癌症中的多药耐药性.
研究的目的:
- 为了确定抑制P-葡萄糖蛋白 (P-gp) 活性的新型天然化合物.
- 验证一种基于结构的药模拟和基于对接的虚拟选方法,用于发现P-gp抑制剂.
主要方法:
- 从ZINC数据库对P-gp结构进行大约20万种天然化合物的虚拟选 (PDBID:6qee).
- 对接研究和3D常见特征药模拟,以区分P-gp基质和抑制剂.
- 实验验证使用ATPase活性试验和基于细胞的试验,使用zosuquidar作为参考抑制剂.
主要成果:
- 在13种优先考虑的化合物中,有8种表现出P-gp抑制活性.
- 在ATPase测定中,六种化合物表现出显著的抑制,IC50值低于5μM.
- 通过两种不同的基于细胞的体外试验方法进一步证实了抑制活性.
结论:
- 基于综合结构的药模拟和对接方法有效预测新型P-gp抑制化合物.
- 已识别的化学支架为开发更强大的P-gp抑制剂提供了基础.
- 这一战略有望加速为ABC传送器发明调制器的发现.
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