在海洋生物膜发育过程中,微生物群落组成和二次新陈代谢的顺序
Pernille Kjersgaard Bech1, Scott A Jarmusch1, Jacob Agerbo Rasmussen2
1Department of Biotechnology and Biomedicine, Technical University of Denmark, Kgs. Lyngby, DK-2800, Denmark.
ISME communications
|February 23, 2024
概括
海洋生物膜的继承涉及微生物群落及其二次代谢物生产的转变. 早期阶段有利于具有高非核糖体潜力的细菌,而后期阶段则看到这种潜力的减少和真核细胞的增加.
科学领域:
- 微生物生态学 微生物生态学
- 海洋生物学 海洋生物学
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 生物膜动力学 生物膜动力学
背景情况:
- 二次代谢产物对于复杂社区中的微生物相互作用至关重要.
- 微生物群落动态与二次代谢物潜力之间的联系尚不清楚.
研究的目的:
- 调查海洋生物膜社区继承与二次新陈代谢变异之间的关系.
- 在生物膜发育过程中跟踪分类学,生物合成基因集群和代谢组动态.
主要方法:
- 16S和18S的rRNA基因和腺化域的amplicon测序.
- 基因组解决的元基因组学.
- 没有目标的代谢学.
- 在现场监测超过113天.
主要成果:
- 确定了两个不同的社区继承阶段,在第29天左右出现了显著的转变.
- 在第29天之后检测到类二次代谢产物 (伪素).
- 早期的继承是由具有高非核糖体合成酶潜力的原核生物主导 (例如,Myxococotta spp. ) 的情况.
- 晚期继承显示多细胞真核生物 (生动物,足动物) 的增加和微生物非核体潜力的减少.
结论:
- 海洋生物膜的继承显示了微生物群落结构和二次代谢物产生的明显过渡.
- 早期生物膜阶段的特点是 prokaryotic 主导和高非核糖体合成酶潜力.
- 后期阶段受到真核生物殖民的影响,与细菌非核糖体产量的减少有关.
