转录组分析揭示了Coprinopsis cinerea中菌体和果实对化的反应
Po-Lam Chan1, Hoi-Shan Kwan2, Yichun Xie2,3
1Research Institute for Future Food, The Hong Kong Polytechnic University, Hong Kong SAR, China.
Journal of fungi (Basel, Switzerland)
|February 23, 2024
概括
化 (LiCl) 促进菌根的生长,但抑制了基底菌种菌Coprinopsis cinerea的果实体的形成. 这种效应与代谢和细胞过程的基因表达变化有关,可能是通过GSK3抑制.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 菌类的发展 菌类的发展
背景情况:
- 化 (LiCl) 用于在各种生物体的分子研究中.
- 它在基础菌类真菌中的特定作用,如Coprinopsis cinerea,仍然未被充分探索.
- 了解LiCl对真菌发育的影响对于分子和信号通路研究至关重要.
研究的目的:
- 研究LiCl对Coprinopsis cinerea的生长和发育的影响.
- 通过使用RNA-Seq. 来识别通过LiCl处理调节的基因和通路.
- 阐明LiCl诱导的真菌发育变化的基础分子机制.
主要方法:
- 使用RNA-Sequencing (RNA-Seq) 来分析LiCl处理的基因表达特征,并控制Coprinopsis cinerea.
- 在两个不同的时间点进行了差异基因表达分析.
- 对差异表达基因 (DEGs) 进行了途径丰富分析.
主要成果:
- 化显著增强了菌体的生长,同时抑制了C. cinerea.中果实体的形成.
- 在菌和菌结阶段发现了大量的差异表达基因 (DEGs).
- 丰富分析将DEG与促进生长的代谢途径和参与抑制果实生长的细胞过程 (细胞循环,半转化) 联系起来.
结论:
- 液化通过调节代谢和细胞过程途径来影响C. cinerea的发展.
- 这些发现表明,LiCl对果实体形成的抑制作用是由抑制糖原合成酶激酶3 (GSK3) 介导的.
- 这项研究为LiCl在基础菌种真菌中的作用的分子机制提供了新的见解.


