从健康人群和性结肠炎患者中获得的结肠上皮器官长时间培养会导致LINE-1甲基化水平的下降
Ruta Inciuraite1, Ruta Steponaitiene1, Odeta Raudze1
1Institute for Digestive Research, Academy of Medicine, Lithuanian University of Health Sciences, A. Mickeviciaus St. 9, 44307, Kaunas, Lithuania.
Scientific reports
|February 23, 2024
概括
长期培养肠道有机体会降低LINE-1甲基化. 这种表观遗传变化根据患者的诊断而有所不同,这表明LINE-1是ex vivo培养的生物标志物.
科学领域:
- 胃肠病学 胃肠病学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 干细胞生物学 干细胞生物学
背景情况:
- 来自患者的人类肠道器官对于研究消化系统疾病至关重要.
- 从健康和性结肠炎 (UC) 患者的结肠器官中对基因组甲基化进行培养的长期影响基本上是未知的.
研究的目的:
- 在长时间培养过程中评估结肠上皮器官的表观遗传稳定性.
- 评估LINE-1的甲基化水平作为全球甲基化状态的生物标志物.
主要方法:
- 从健康对照组和UC患者 (活跃和静止) 的结肠组织和衍生器官中分析LINE-1甲基化水平.
- 起源组织,短期培养和长期亚培养有机体之间的甲基化水平的比较.
- 在长时间培养期间评估甲基化变化.
主要成果:
- 在健康和UC结肠组织和器官中,LINE-1区域呈现出高甲基化水平 (>60%).
- 与原始组织和短期培养相比,长期培养结肠有机体导致LINE-1甲基化降低 (高达8%).
- 在亚培养过程中LINE-1甲基化下降的速度根据患者的诊断 (健康,活跃UC,静止UC) 不同.
结论:
- LINE-1甲基化是患者衍生的肠上皮器官的全球甲基化状态的可靠指标.
- 在常规的ex vivo有机体培养中,LINE-1可以作为评估表观遗传稳定的潜在生物标志物.
- 通过LINE-1甲基化测量的表观遗传稳定性受到长期培养和患者的疾病状况的影响.
