选择和验证基因表达基因表达的参考基因在不同的杀虫剂压力下的Bactericera gobica Loginova
Hongshuang Wei1, Jingyi Zhang1, Mengke Yang1
1Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100193, China.
International journal of molecular sciences
|February 24, 2024
概括
选择稳定的参考基因 (RGs) 对于研究害虫菌 Bactericera gobica.的抗昆虫药性至关重要. 这项研究确定了在各种杀虫剂压力和实验条件下RT-qPCR正常化的最佳RG.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 昆虫学 昆虫学是一门学科.
- 虫害管理 虫害管理 虫害管理
背景情况:
- 像Bactericera gobica这样的害虫对杀虫剂的耐药性对作物保护构成了重大挑战,特别是对于药用植物,如Lycium barbarum.
- 通过RT-qPCR精确量化基因表达对于理解抗虫剂机制至关重要.
- 可靠的RT-qPCR需要选择和验证稳定的参考基因 (RG) 以实现正常化.
研究的目的:
- 确定和验证最稳定的参考基因 (RGs) 用于RT-qPCR在Bactericera gobica中的正常化.
- 评估RG在各种条件下的稳定性,包括五种杀虫剂应力和四种其他实验因素.
- 为未来研究B. gobica.抗虫剂机制的研究提供基础.
主要方法:
- 从B. gobica. 的转录组数据中选择了15个候选RG.
- 通过使用五种算法 (Delta Ct,GeNorm,Normfinder,BestKeeper,RefFinder) 评估了RG表达稳定性.
- 验证涉及分析不同杀虫剂治疗和实验条件的RG性能.
主要成果:
- 特定的RG对被确定为不同杀虫剂压力 (例如,Imidacloprid/Abamectin的RPL10 + RPS15) 和实验条件 (例如,气味刺激的EF1α + RPL8) 的最佳.
- 在所有测试条件下,EF2和RPL8成为最稳定的RG.
- α-TUB和RPL32被确定为最不稳定的RGs.
结论:
- 这项研究提供了第一个全面验证的参考基因RT-qPCR在B. gobica女在杀虫剂压力下.
- 确定了最佳的RG,确保精确的基因表达分析,促进对抗虫剂耐药性的进一步调查.
- 这些发现支持开发有效的杀虫剂减少策略,用于管理B. gobica.
