肺部病原体Mycobacterium abscessus中占主导地位的孤儿分泌体通过多层增长阶段驱动的战略揭示了

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 菌根是一种新兴的肺部病原体,病毒性因素尚不清楚.
• 识别分子点对于开发诊断和治疗方法至关重要.

研究的目的:

• 为了全面识别Mycobacterium abscessus的秘密体. 为了全面识别Mycobacterium abscessus的秘密体.
• 发现用于诊断,治疗和疫苗开发的新目标.

主要方法:

• 利用结合遗传/基因组,蛋白质组和生物信息学方法的多方策略.
• 采用溶液中消化的自下而上的蛋白质组学,2D凝电泳 (2D-GE) 蛋白质组学,以及基于记者基因融合的基因组图书馆.
• 使用Psortb 2.0和SignalP 3.0进行全基因组信号序列分析,并减去脂蛋白和跨膜蛋白.
• 与Mycobacterium结核病数据库进行了同类搜索.

主要成果:

• 鉴定了总共600种分泌的蛋白质.
• 蛋白质组学确定了517种 (自下而上) 和33种 (2D-GE) 蛋白质.
• 基因组方法检测到23种分泌蛋白质,生物信息分析产生116.
• 通过同源性搜索确定了9种额外的同源性.
• 方法之间没有观察到明显的重叠,突出显示了需要采用多方位方法的必要性.
• 超过50%的已识别的分泌蛋白质是"孤儿",其功能尚不清楚.

结论:

• 使用联合策略建立了Mycobacterium的全面分泌组.
• 已识别的孤儿蛋白质代表了开发有针对性的干预措施的新型资源.
• 这项研究为未来对M. abscessus毒性和宿主相互作用的研究提供了基础.