登革热病毒的遗传学,流行病学和时间模式在阿拉卡拉拉,圣保罗州
Caio Santos de Souza1, Giovana Santos Caleiro1,2, Ingra Morales Claro3,4
1Laboratório de Virologia, Instituto de Medicina Tropical, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, SP, Brazil.
Viruses
|February 24, 2024
概括
登革热病毒1型 (DENV-1) 基因型V已多次引入巴西阿拉卡拉拉,这可能解释了其持续存在的原因. 这项研究揭示了基因型V的最近差异比以前认为的要大.
科学领域:
- * 病毒学和分子流行病学
- * 树木病毒学和公共卫生
背景情况:
- *登革热病毒 (DENV) 导致全球显著的发病率,巴西正在经历由血清型替代驱动的反复流行.
- * 自2010年以来,阿拉卡拉拉州的DENV-1流行病率有所增加,但病毒循环动态和遗传特征仍然不明.
研究的目的:
- *为了研究1型登革热病毒 (DENV-1) 的进化史和遗传多样性,在巴西圣保罗市阿拉卡拉拉.
- *重建该地区DENV-1基因型V系的引入和多样化.
主要方法:
- *从阿拉卡拉拉 (2015-2022) 获得37个完整或部分DENV-1基因组的家族遗传学分析.
- *与巴西和全球DENV-1序列进行比较分析.
- *对DENV-1,基因型V及其系的最近共同祖先 (tMRCA) 的时间估计.
主要成果:
- *在过去十年中,至少有三次DENV-1基因型V的引入阿拉库拉拉,包括两个主要的血统 (L Ia/L Ib和L II).
- * 最早采样血统 (2015/2016) 的tMRCA约为2008年.
- *证据表明,DENV-1基因型V的分歧比以前确定的更为最近.
结论:
- *多次引入和独特的DENV-1基因型V系的存在可能导致DENV-1在阿拉卡拉拉拉长时间存在.
- *这些发现挑战了DENV-1基因型出现的现有时间表,强调了更新流行病学模型的必要性.
