先进的胃肠道 stromal 瘤:通过机器学习可靠地分类 imatinib 血最低度
Pan Ran1, Tao Tan1, Jinjin Li1
1Department of Gastrointestinal Surgery, the First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing, 400016, China.
BMC cancer
|February 24, 2024
概括
监测伊马替尼的血最低度 (IM Cmin) 对于晚期胃肠道 stromal 瘤 (GISTs) 是至关重要的. 这项研究开发了一个XGBoost模型,使用患者数据来预测低IM Cmin,帮助GIST患者的治疗决策.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 生物统计学 生物统计学
背景情况:
- 晚期的胃肠道 stromal 瘤 (GISTs) 通常需要伊马替尼 (IM) 治疗.
- 在1100 ng/ml以下的低于最佳意马替尼的血最低度 (IM Cmin) 与治疗效率的降低有关.
- 建议监测IM Cmin以优化GIST患者的治疗结果.
研究的目的:
- 开发一个IM Cmin的预测分类模型,用于中国患者的先进GISTs.
- 确定与IM Cmin.相关的关键临床和实验室变量.
- 为IM Cmin预测选择最准确的机器学习模型.
主要方法:
- 来自高级GIST患者的数据分为培训 (60%),验证 (20%) 和测试 (20%) 组.
- 最小绝对缩小和选择运算符 (LASSO) 回归和阶段二进制物流回归确定了关键变量.
- 使用布里尔分数,AUROC,决策曲线和AUPR的九个机器学习模型进行了比较.
- 最佳模型使用十倍交叉验证和单独的测试集进行了验证.
主要成果:
- 六个变量 (性别,每日IM剂量,转移部位,红细胞计数,血小板计数,中性粒细胞百分比) 被选择为模型.
- 极端梯度增强 (XGBoost) 模型在验证集中表现出卓越的性能 (最高的AUROC,最低的Brier分数,最高的AUPR).
- 内部验证证实了XGBoost模型在测试组中的有效性,达到0.725.7的AUROC.
结论:
- 初步的临床和实验室数据可以有效地预测如果IM Cmin低于1100 ng/ml在先进的GIST患者.
- 开发的XGBoost模型提供了一个潜在的工具,以帮助临床医生指导伊马替尼布的使用.
- 基于预测模型的个性化监测和剂量调整可能会改善GIST治疗结果.
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