使用完全自动化的蛋白质组学样本准备平台进行高通量药物标发现.
Qiong Wu1, Jiangnan Zheng1,2, Xintong Sui1
1Department of Chemistry, School of Science, Southern University of Science and Technology Shenzhen 518055 China tianrj@sustech.edu.cn.
Chemical science
|February 26, 2024
概括
这项研究引入了一种自动化工作流程,用于使用单温度热蛋白质组概况 (TPP) 和质谱 (MS) 发现药物标. 该方法显著提高了识别药物标和非标的吞吐量,解决了药物开发中的低效率问题.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 药物发现 药物发现 药物发现
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 药物开发面临高成本和低效率,原因是效率和毒性差.
- 基于质谱 (MS) 的蛋白质组学,特别是定量蛋白质组学,可以揭示耐药性和非目标效应.
- 热蛋白质组概况 (TPP) 对于蛋白质组范围的药物标识是有价值的,但受到样本体积和变异性的限制.
研究的目的:
- 开发一个高通量药物目标发现工作流.
- 整合单温度TPP,自动化样本准备和数据独立采集 (DIA) 以提高效率.
- 在大规模分析中克服传统TPP的局限性.
主要方法:
- 使用全自动化蛋白质组学样本准备平台 (autoSISPROT) 高吞吐量处理高达96个样本.
- 集成自动SISPROT与单一温度TPP和数据独立获取 (DIA) 进行定量蛋白质组学.
- 采用TPP来识别药物标和非标的酶抑制剂.
主要成果:
- 自动SISPROT平台在不到2.5小时内处理了96个样本,具有高消化 (>94%) 和TMT标签 (>98%) 的效率.
- 实现了优异的可重复性,具有>0.9的批量内和批量间皮尔森相关系数.
- 在87个样本中确定了20种激酶抑制剂的已知和潜在的非目标,与经典TPP相比,显示了超过10倍的吞吐量增加.
结论:
- 拟议的自动化工作流大大提高了药物标和非标识别的吞吐量.
- 这种方法为药物发现中的蛋白质组学样本准备提供了强大而高效的解决方案.
- 综合工作流解决了确定药物机制和潜在不良影响的关键挑战.


