基于机器学习和实验验证的预测与神经病痛中的烧伤相关的诊断生物标志物
Sheng Tian1,2, Heqing Zheng1,2, Wei Wu1,2
1Department of Neurology, the Second Affiliated Hospital, Jiangxi Medical College, Nanchang University, Nanchang, 330006, People's Republic of China.
Journal of inflammation research
|February 26, 2024
概括
这项研究确定了五个与灭相关的基因 (PRG),这些基因对神经病痛 (NP) 发展至关重要. 像Tlr4,Il1b和Casp8这样的基因显示出诊断潜力,突出显示了热死.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 神经病痛 (NP) 是一种具有复杂潜在机制的衰弱性疾病.
- 炎症性炎症,一种被编程细胞死亡的亲炎症形式,与NP的发病有关.
- 精确的分子参与者和NP中热的途径仍然不完全理解.
研究的目的:
- 识别神经病痛中差异性表达的关键 pyroptosis 相关基因 (PRGs).
- 在NP中阐明这些PRG的分子机制和诊断潜力.
- 探索PRG在NP的神经免疫微环境中的作用.
主要方法:
- 对基因表达数据集 (GSE24982,GSE60670) 的机器学习分析,以识别与热死相关的差异表达基因 (PRDEG).
- 基因本体学 (GO),基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 和基因组丰富分析 (GSEA) 用于功能丰富.
- 接收机操作者特征 (ROC) 分析用于诊断价值评估和RT-qPCR用于验证.
- 使用CIBERSORTx进行免疫透分析,将PRDEG与免疫细胞群相关联.
主要成果:
- 使用LASSO回归和随机森林确定了五种PRDEG,并通过RT-qPCR进行验证.
- 丰富分析表明PRDEGs参与神经元死亡调节,IL-4,IL-23和NF-κB信号通路.
- 在NP中,ROC分析表明大多数已识别的PRDEG具有显著的诊断潜力.
- PRDEGs与树突细胞,单细胞和卵泡T辅助细胞有相关性,这表明神经免疫参与.
结论:
- 五种PRDEG,包括Tlr4,Il1b和Casp8,作为神经病痛的潜在生物标志物.
- 这些发现提供了进一步的证据,证明了热在NP中的关键作用.
- 鉴定的PRDEG及其免疫细胞相关性为NP的神经免疫调节机制提供了洞察力.
