在化学品的定性和定量基因毒性评估中释放转录基因生物标记物的力量
Anouck Thienpont1,2, Eunnara Cho3, Andrew Williams3
1Department of In Vitro Toxicology and Dermato-Cosmetology, Vrije Universiteit Brussel (VUB), 1090 Brussels, Belgium.
Chemical research in toxicology
|February 26, 2024
概括
像GENOMARK和TGx-DDI这样的新方法方法 (NAM) 改善了基因毒性测试. 将这些生物标志物结合在HepaRG细胞中,为危险识别和功效排名提供了补充数据,减少了对动物的测试.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物标志物开发 生物标志物开发
背景情况:
- 传统的基因毒性测试严重依赖于动物模型.
- 新方法方法 (NAM) 对于现代化毒性评估和提供与人类相关的数据至关重要.
- 转录基因生物标志物GENOMARK和TGx-DDI在基因毒性分类中显示出高准确度.
研究的目的:
- 评估GENOMARK和TGx-DDI生物标志物的整合在HepaRG细胞中的基因毒性评估.
- 确定这些生物标志物的结合是否为危害识别和功效排名提供了补充信息.
- 评估GENOMARK生物标志物与高通量TempO-Seq技术的适用性.
主要方法:
- 肝炎RG细胞暴露于10种化学物质 (8种基因毒性,2种非基因毒性) 在不同度下72小时.
- 用TempO-Seq技术生成基因表达数据.
- 对TempO-Seq的GENOMARK适用性得到证实,预测性能达到100%.
- 使用基准度建模,将GENOMARK和TGx-DDI之间的分类和强度排名进行了比较.
主要成果:
- 当应用到TempO-Seq数据时,GENOMARK证明了100%的预测准确性.
- 在化学品的危险分类中,GENOMARK和TGx-DDI都显示出很高的一致性.
- 基因毒性化学品的功效排名在两个生物标志物之间也高度一致.
- 该研究证实了GENOMARK与TempO-Seq平台的适用性.
结论:
- 将GENOMARK和Tgx-DDI生物标志物集成到HepaRG细胞中,可以提高基因毒性危险的识别和强度排名.
- 这些NAM的组合为基因毒性评估中的证据权重方法提供了有价值的补充信息.
- 这种综合方法支持基因毒性测试的现代化,远离动物依赖.
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