类似crass的菌体:从人类便转基因组的发现到作为微生物源追踪标记物的应用
Arun Thachappully Remesh1, Rajlakshmi Viswanathan2
1Bacteriology Group, ICMR - National Institute of Virology, Pune, Maharashtra, India.
Food and environmental virology
|February 27, 2024
概括
像Crass这样的菌体是大量的肠道病毒. 它们的检测有助于追踪水中的便污染,并可能表明诸如自身免疫性疾病等健康状况.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 病毒学 病毒学
- 人类微生物组研究研究
背景情况:
- 类似crass的菌体是人类肠道微生物群中无处不在和丰富的菌体群.
- 最初与 Bacteroides spp. 相关,它们的宿主现在包括来自 Bacteroidetes 和 Firmicutes 类的物种.
- 它们在污水污染水中的存在和与肠道微生物的相关性导致它们在微生物源追踪 (MST) 中使用.
研究的目的:
- 审查发现,基因组特征,结构,分类学,隔离,和分子检测的crAss类菌体.
- 探索使用类似crAss的菌体作为微生物源追踪标记物的应用.
- 讨论类菌体在调节肠道微生物群中的作用及其与各种疾病的关联.
主要方法:
- 对于初步发现的元基因组学.
- 聚合酶链反应 (PCR) 和实时PCR测定用于分子检测.
- 相关性分析以确定宿主范围和环境应用.
主要成果:
- 类似crass的菌体在肠道微生物群中非常丰富和多样化.
- 分子测试表明,在水源中检测人类便污染的特异性很高.
- 类似crAss的菌体的丰度和多样性减少与性结肠炎,肥胖和自身免疫性疾病等疾病有关.
结论:
- 类似crass的菌体是肠道病毒组的重要组成部分,对人类健康有影响.
- 它们作为环境水中的微生物源追踪的有效标记物.
- 对crAss类菌体的进一步研究可能会揭示对肠道微生物组功能和疾病发病的新见解.
