多孔板盖,用于单步聚合96个样本,用于基于条形码的高通量测序
Stéphanie Boder-Pasche1, Mustafa Demir2,3, Sarah Heub4
1CSEM SA Centre Suisse d'Electronique et de Microtechnique, Jaquet-Droz 1, CH-2002, Neuchâtel, Switzerland. stephanie.boder@csem.ch.
Biomedical microdevices
|February 28, 2024
概括
一个新的聚合盖子简化了大量RNA条形码和测序 (BRB-seq) 样本的准备. 这项创新使生物库和药物发现能够快速,经济高效,高通量RNA测序.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 高通量转录组学,特别是RNA测序 (RNA-seq),对于生物和临床研究至关重要,推动生物标志物和治疗开发.
- 目前的RNA-seq工作流程由于繁的样本准备步骤而面临高通量可扩展性的局限性.
- 大量RNA条码和测序 (BRB-seq) 旨在提高吞吐量,但需要优化样本准备.
研究的目的:
- 开发和验证一种新型的聚合技术,以便在BRB-seq工作流程中精简样本准备.
- 为了解决手动样本处理和试剂消耗在高通量RNA测序中的局限性.
- 为了实现成本效益和大规模的样本处理用于转录基因分析.
主要方法:
- 开发一款智能实验室器件聚合盖,集成流体功能,用于标准的96孔板.
- 在单个聚合步骤中展示快速 (不到一分钟) 和高效率 (超过90%) 的液体回收.
- 从原型到大规模注塑成型制造的聚合盖的过渡.
主要成果:
- 聚合盖成功地使96个样本从多井板同时聚合到一个单管中.
- 该技术证明了有效的DNA条形码聚合用于随后的测序,验证了其在BRB-seq.中的实用性.
- 与传统方法相比,该系统显著降低了试剂消耗和手工劳动.
结论:
- 开发的聚合盖是提高BRB-seq工作流程吞吐量的一个有价值的工具.
- 这一创新为转录学中的大规模样本准备提供了具有成本效益的解决方案.
- 该技术有可能通过高效的RNA测序加速生物标志物发现和治疗开发.


