使用甲固态嵌组织来表征p16阳性和p16阴性舌头状细胞癌中的微生物群:试点研究

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 微生物学 微生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 舌状细胞癌 (TSCC) 是最常见的口腔癌.
• p16免疫组织化学是头部和部状细胞癌的关键预后和预测工具.
• 口腔微生物群在TSCC发展中的作用越来越被认可,但其与p16状态的关联仍然不清楚.

研究的目的:

• 调查和比较p16阳性和p16阴性TSCC患者之间的口腔微生物组合.
• 探索TSCC中观察到的微生物差异的潜在功能影响.

主要方法:

• 从TSCC患者的甲固定嵌 (FFPE) 组织样本中提取了DNA.
• 微生物组使用16S-rRNA基因测序进行了分析.
• 使用PICRUSt,Tax4Fun和BugBase预测了微生物组的功能潜力.

主要成果:

• 与p16阴性患者相比,p16阳性TSCC患者的微生物群多样性显著更高.
• 包括Desulfobacteria,Limnochordia和Anaerolineae在内的特定细菌种群的丰度在p16阳性TSCC中升高.
• 功能预测表明,这些增加的细菌可能有助于p16阳性TSCC中的病毒致癌.

结论:

• 在p16阳性和p16阴性TSCC之间存在细菌特征的显著差异.
• 这些发现凸显了TSCC中p16状态和特定口腔微生物种群之间的潜在联系.
• 鉴定到的细菌可能代表TSCC治疗的新型治疗点.