在便免疫化学测试便样本中探索肠道DNA病毒组,在一项基于人口的大规模研究中揭示了与生活方式的关联

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 病毒学 病毒学
• 人类肠道微生物组研究研究

背景情况:

• 在全球范围内,便免疫化学测试 (FIT) 对结直肠癌查至关重要.
• 肠道病毒群,肠道中的病毒群落,仍然在很大程度上没有表征.
• 了解肠道病毒组合及其与宿主因子的关系至关重要.

研究的目的:

• 通过 shotgun metagenome 测序在人类便样本中识别,注释和表征DNA 病毒.
• 研究生活方式/人口统计因素与肠道病毒组合之间的关联.
• 评估FIT样本对于大规模病毒组分析的适用性.

主要方法:

• 在挪威的一项结直肠癌查研究 (CRCbiome) 中,从1034名参与者的便样本中进行了枪支元基因组测序.
• 用于DNA病毒识别,注释和分类学分类的生物信息分析.
• 统计分析以将病毒形状与25个生活方式和人口统计变量相关联.

主要成果:

• 鉴定了超过18,000种DNA病毒,只有6%被分配给已知的家族;Microviridae是最常见的.
• 在25个生活方式/人口统计学变量中的17个与肠道病毒组之间发现了显著的关联.
• 身体活动,吸烟和食纤维摄入量与病毒多样性,丰富性和代谢基因丰富性有很强的联系.

结论:

• FIT样本适用于综合性肠道病毒组分析,使大规模研究成为可能.
• 宿主生活方式因素对肠道病毒组的组成和功能有深远的影响.
• 鉴定的病毒种群及其生活方式的关联为研究肠道病毒组在健康和疾病中的作用开辟了新的途径.