早期人类肠道病毒的元基因组目录
Shuqin Zeng1,2, Alexandre Almeida3, Shiping Li1,2
1Department of Pediatrics, West China Second University Hospital, Sichuan University, Chengdu, China.
Nature communications
|February 29, 2024
概括
早期肠道病毒组 (ELGV) 目录揭示了婴儿中的新型病毒物种,其中许多与成人数据库不同. 本资源有助于了解婴儿肠道健康,并识别儿科疾病与病毒的联系.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 病毒学 病毒学
- 儿科 儿科 儿科
背景情况:
- 人的肠道微生物组对婴儿健康至关重要,但肠道病毒组在很大程度上仍然没有特征.
- 了解生命早期的病毒组对于婴儿肠道平衡和健康结果至关重要.
研究的目的:
- 建立早期肠道病毒组 (ELGV) 目录,这是婴儿病毒序列的全面资源.
- 在婴儿肠道病毒组中识别新型病毒物种和潜在的生物标志物.
- 分析早期肠道病毒组的时间动态和临床关联.
主要方法:
- 从8130个婴儿肠道样本中编目160,478个病毒序列,使用病毒样颗粒 (VLP) 丰富和批量转基因组学.
- 集群病毒序列以识别82,141个不同的病毒物种.
- 分析纵向数据以追踪病毒组发育和与临床因素的关联.
主要成果:
- 确定了82,141种病毒物种,与现有的成年人数据库相比,其中68.3%是新鲜的.
- 从VLP丰富和散装元基因组中发现了潜在的婴儿特异性病毒生物标志物.
- 追踪婴儿肠道病毒的不稳定性和时间发展,识别与临床因素相关的差异性病毒.
结论:
- 该ELGV目录提供了早期人类肠道病毒的最广泛的元基因组蓝图.
- 这一资源将有助于在未来发现儿科疾病与病毒的关联.
- 扩大了对母婴共享病毒组和肠道病毒组-细菌组在生命早期的相互作用的理解.
