在初级胆管胆道炎和自身免疫性肝炎变体综合征中,用于药物反应特征的多omics方法
Fan Yang1, Leyu Zhou1, Yi Shen1
1Department of Gastroenterology and Hepatology and Sichuan University-University of Oxford Huaxi Joint Centre for Gastrointestinal Cancer, West China Hospital, Sichuan University, #37 Guoxue Road, Chengdu, 610041, Sichuan, China.
Journal of translational medicine
|February 29, 2024
概括
在原发性胆道胆道炎和自身免疫性肝炎变体综合征 (PBC/AIH VS) 中确定了药物反应的生物标志物. 整合基因组,代谢和细胞因子学数据的预测模型准确地预测治疗反应,使及时干预成为可能.
科学领域:
- 肝病学 肝病学是一种肝病学.
- 基因组学就是基因组学.
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 主要胆道胆炎和自身免疫性肝炎变体综合征 (PBC/AIH VS) 呈现出复杂的重叠,预后比单独PBC或AIH更差.
- 在PBC/AIH VS中影响药物反应的生物标志物和分子机制仍然不完全理解.
研究的目的:
- 识别与药物反应相关的差异表达RNA,代谢资料和免疫细胞/细胞因子特征在PBC/AIHVS.中.
- 开发一种预测模型,用于在患有PBC/AIHVS的患者中预测不足的生化反应.
主要方法:
- 全转录组测序,基因本体学和KEGG通路分析.
- 血代谢学,流细胞测量和免疫检测用于免疫分析.
- 后勤回归和ROC曲线分析以构建和验证预测模型.
主要成果:
- 鉴定了差异表达的mRNAs,lncRNAs,circRNAs和miRNAs,在脂质代谢和免疫反应途径中进行丰富.
- 发现了特定的脂质 (PC (18:2/18:2) 和PC (16:0/20:3)) 作为预测剂,并在良好与不良反应者中表征了免疫细胞和细胞因子的特征.
- 开发了一个具有高AUC (0.986初级,0.940验证) 的生物化学反应预测模型.
结论:
- 一个组合的基因组,代谢和细胞因子学模型准确地预测了PBC/AIHVS的治疗反应不足.
- 早期识别有风险的患者有助于迅速启动额外疗法以改善结果.
