热'n Beat:一个通用高通量端到端的蛋白质学样本处理平台,在不到一个小时的时间内完成

科学领域:

• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 质谱测量质量谱测量
• 生物化学 生化学

背景情况:

• 对小型固体组织样本 (≤2毫克) 的高通量蛋白质组分析需要全面覆盖.
• 现有的方法面临着各种样本格式的挑战,需要大量的准备.
• 需要一个快速,强大和通用的样本准备协议,用于质谱.

研究的目的:

• 开发一种通用,快速和强大的样本准备协议,用于高通量蛋白质组分析.
• 为各种组织类型和固定方法优化一管均化和消化方法.
• 为了证明该协议的效率,产量和在各种生物样本中的一致性.

主要方法:

• 开发了"热与打击" (HnB) 一管均化和消化方法.
• 适应新鲜冷 (FF),FF-OCT和FFPE组织的样品清洗和清洁.
• 优化组织破坏,溶解,还原,化和蛋白质分解在一个单一的快速步骤.

主要成果:

• 与以前的方法相比,HnB协议显著增加了的产量.
• 在38分钟 (总共53-63分钟) 中实现高消化效率 (85-90%) 的核心处理.
• 在六种器官类型,细胞系和癌症活检上表现出强度.
• 在92小时内成功处理了1171个FF-OCT人类癌症活组织,为3513个MS运行提供了一致的结果.

结论:

• 热与击 (HnB) 协议为高通量组织蛋白质组分析提供了通用,快速和强大的解决方案.
• 该方法适用于各种组织类型和固定方法,增强蛋白质组覆盖和效率.
• HnB显著简化了样本准备,使大规模的蛋白质组学研究能够使用一致的高质量数据.